Anaconda恢复官方镜像

Ft 2021-10-10 AM 9℃ 0条

最佳解决办法是删除所有第三方镜像链接,恢复到默认设置。

命令如下:

conda config --remove-key channels
conda config --show # 查看conda的配置,确认channels
conda config --show-sources # 仅查看所有镜像

pip
关于pip,conda 4.5不再支持用pip安装conda:

As of conda 4.5, we do not supportpip install conda. However, we are considering that as a supported bootstrap method in the future.
https://conda.io/projects/conda

镜像管理

  1. 添加一个镜像:

    conda config --add channels 'https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/' # 添加镜像
    conda config --set show_channel_urls yes # 设置搜索时显示channel地址
    conda config --show-sources # 查看conda的镜像

  2. 删除某个镜像:

方法1:使用代码修改

# 注意链接要有引号,英文输入法
conda config --remove channels 'https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/' 
# 查看conda的镜像,确认已删除
conda config --show-sources

方法2:使用vim修改

vim ~/.condarc
# 按i进入输入模式
# 按Esc跳到命令模式
# 输入 :wq 保存文件并退出vi

四、conda常见操作

  1. 环境管理

    创建环境

    conda create -n bioinfo

    加载环境

    source activate bioinfo

    在该环境安装package(注意,当前被激活的环境会显示有一个星号或者括号。)

    conda install tophat

    返回默认环境

    deactivate bioinfo # For Windows
    source deactivate bioinfo # For Linux & Mac

    复制一个环境,如bioinfo

    conda create -n bioinfo --clone bioinfo_clone

    删除一个已有环境,如bioinfo_clone

    conda remove --name bioinfo_clone --all

    查看所有环境

    conda env list

2.包管理

# 安装package,conda默认安装软件的最新版本
conda install -n bioinfo tophat
# -n可指定环境名称,不使用该参数则被安装在当前活跃环境,一定要确认清楚是哪个环境!!!
# -c可指定使用某个channel安装

# 查找package信息
conda search tophat

conda search tophat
# 安装某个版本的package,使用conda install package=version
conda install tophat=2.1.1

# 更新package
conda update -n bioinfo tophat

# 删除package
conda remove -n bioinfo tophat
# 或者
conda uninstall -n bioinfo panda

# 查看conda版本
conda -V # 注意V大写

# 更新conda
conda update conda

# 更新anaconda
conda update anaconda

# 查看当前环境的安装包
conda list

# 查看指定环境的安装包,比如bioinfo 
conda list -n bioinfo

#安装anaconda后启动终端头部会有(base)如何解决
#原因是安装conda后,每次启动终端,都会自动启动conda的base环境
conda config --show
conda config --set auto_activate_base False

注意:不是所有的软件都可以用conda安装,如果conda报错,可以去该软件官网直接下载安装包安装。

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标签: Anaconda

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